CARTOGRAFÍA DEL GENOMA EN EUCARIOTAS Localización de

20/12/2010
1.- Fundamentos p
para la construcción de un mapa
p genético.
g
2.- Detección de ligamiento entre dos genes
3. Cálculo de la frecuencia de recombinación
4.- Cruzamiento de tres puntos
5.- Interferencia y coincidencia
6 Relación entre distancia genética y frecuencia de recombinación
6.* Unidad de mapa
* Función de mapa
CARTOGRAFÍA DEL GENOMA EN EUCARIOTAS
I - MAPA GENÉTICO
I.
TEMA 10
Localización de genes basada en
frecuencia de recombinación
II.- MAPA FÍSICO
TEMA 11
Localización de genes basada en:
- Hibridación somática interespecífica
- FISH
- Secuenciación....
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"The linear order of the genes implies distance between
them, for which the crossover values stand as indices.
It is obvious that if the order of the genes remained
the same but something doubled the number of
crossovers between two loci, their 'distance' apart
would at thesame time appear to have doubled… "
- Thomas Hunt Morgan, The Physical Basis of
Heredity,
y 1919
(concluding remarks from the chapter entitled
"The Order of the Genes".)
A principios de siglo...
“ Cuanto mayor es la distancia entre genes ligados, mayor es la
probabilidad de que ocurra un entrecruzamiento entre cromátidas
no hermanas en la zona de separación de estos genes y por tanto
mayor será el número de descendientes recombinantes “
% de recombinación
medida de la distancia genética
INDIVIDUO AaBb
- Si A y B son independientes
aB
Ab
50%
- Si A y B están ligados (en acoplamiento)
aB
Ab
< 50% (Frecuencia de recombinación < 0.5)
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CALCULO FRECUENCIA DE RECOMBINACIÓN
CRUZAMIENTO DE TRES PUNTOS
- Estudiar el ligamiento entre tres loci
1.- Orden
2.- Distancia genética (frec. Recomb.)
+
Color del cuerpo
p
b, b
TRES GENES Color de los ojos p+, p
+
Morfología del ala c , c
Tres notaciones distintas b/b p/p c/c
bbppcc
+
+
+
+ + +
bbppcc x
+
+
bpc/bpc
bbppcc
+
b bp pc c x
bbppcc
bbppcc
+
bbppc c
+
bbp pcc
+
+
bbp pc c
+
b bppcc
+
+
b bppc c
+
+
b bp pcc
+
+
+
b bp pc c
5617
1383
72
367
388
60
1412
5701 / TOTAL 15000
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MAPA GENÉTICO DE TRES LOCI
1º. El gen que está en el centro se puede determinar
mirando los dobles recombinantes.
b
p
c
+
bbp
pcc+
2Q
+
b bppc c
+
+
+
b
p
c
X
X
2º. La distancia más grande determina los loci de
los extremos.
3º.
bpc
o
cpb
4º. La distancia entre los loci dos a dos es > que
la calculada entre los loci de los extremos
“Las distancias de mapa mas exactas son las que
se establecen entre loci ligados muy próximos”
COEFICIENTE DE COINCIDENCIA
Nº de dobles recombinantes observado
Nº de dobles recombinantes esperado
N
- Si es < que 1 quiere decir que la presencia de
determinados quiasmas influye para que no se produzca
otro en un lugar próximo
COEFICIENTE DE INTERFERENCIA
Expresa la reducción del número de dobles quiasmas
observados, en relación a los esperados
( 1 - coeficiente de coincidencia)
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MAPA DE LIGAMIENTO
MAPA GENÉTICO
Frecuencia de
recombinación
ó
Distancia genética
1 UNIDAD DE MAPA = 1cM = F.R. de 0.01 (1%)
Unidad de mapa unidad de medida de mapa genético
Def. Distancia entre dos genes para la que uno de cada 100
productos de la meiosis resulta ser recombinante
Función de mapa
Def. Función matemática que relaciona la frecuencia de
recombinación y la distancia genética
FUNCIONES DE MAPA
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