Ficha del proyecto Título del proyecto

Consejo Nacional de Rectores (CONARE)
División de Coordinación
Área de Investigación
Ficha del proyecto
Título del proyecto
“Estudios
Período de ejecución
Universidades participantes
2011-2013
Universidad de Costa Rica
Universidad Nacional
Gustavo Gutiérrez Espeleta
Nombre y apellidos
(investigador principal)
Nombre y apellidos
(investigadores asociados)
Asistentes
Resumen/Abstract
(máximo 300 palabras)
genéticos, ambientales, infecciosos y
epidemiológicos en Chelonia mydas agassizii
anidante en el Pacífico Norte de Costa Rica”
UCR: Eric Fuchs, Escuela de Biología
Andrea Chaves, Escuela de Biología
Norman Rojas, Facultad de Microbiología
UNA: Mauricio Jiménez, Escuela de Medicina Veterinaria
Kinndle Blanco, Escuela de Medicina Veterinaria
Ana Jiménez, Escuela de Medicina Veterinaria
Andrea Urbina, Escuela de Medicina Veterinaria
Juan Alberto Morales, Escuela de Medicina
Veterinaria
Clemens Rupert, IRET
En la actualidad, la mayoría del trabajo llevado a cabo en
tortugas marinas es hecho de manera retrospectiva a nivel de
manejo o durante situaciones de emergencia. Sin embargo, es
importante transformar las evaluaciones periódicas de
poblaciones a procedimientos más prospectivos, a través de
investigaciones interdisciplinarias que faciliten el análisis de la
situación global de los quelonios.
La propuesta se desarrolló tomando en cuenta la necesidad de
contribuir a la ardua labor desarrollada por organizaciones e
investigadores nacionales e internacionales que colaboran en
estudios de monitoreo, marcaje, vigilancia y otros en quelonios.
Asimismo, reconociendo la necesidad de cubrir los campos del
saber que se incluyen dentro de la propuesta y que no están
siendo desarrolladas en Costa Rica ni en toda Centroamérica.
Es necesario destacar que para mejorar las opciones evolutivas
de la especie, es prioritario el estudio de los componentes
genético, infecciosos, epidemiológico y ambientales, así como
de las interrelaciones de estos. La evaluación de la variabilidad
genética en una misma especie en distintas áreas geográficas es
relevante debido a que se ha determinado una relación
estrecha entre el grado de endogamia. Al mismo tiempo, la
pérdida de opciones evolutivas tiene consecuencias negativas
en la resistencia a enfermedades, siendo las manifestaciones
clínicas del herpesvirus unas de las más importantes en tortugas
marinas, así, como puede potenciar la presencia y éxito de
agentes infecciosos (hongos, parásitos y bacterias) que afecten
el grado de éxito de esta población de quelonios.
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División de Coordinación
Área de Investigación
Objetivo general
Resultados principales
(los que considera más
significativos)
El análisis mediante SIG de estas interrelaciones permitirá
establecer el comportamiento de las variables tanto en tiempo
como en espacio, estableciendo diferencias epidemiológicas e
infecciosas relacionadas con factores ambientales, temporales o
genéticos que favorezcan la presencia de enfermedad.
Analizar las opciones evolutivas de la tortuga negra (Chelonia
mydas agassizii) y tortuga lora (Lepidochelys olivacea) que
desova en el Pacífico de Costa Rica, con base en factores
genéticos, infecciosos, epidemiológicos y ambientales.
Herpesvirus/Fibropapilomatosis:
De un total de 101 individuos analizados para la tortuga negra, 8
de playa Nancite, 16 de playa Naranjo (ambos sitios de tortugas
anidantes) y 77 del Golfo Dulce (tortugas en forrajeo), 18 (17.8%)
individuos, dos en playa Naranjo y 16 (20.8%) en Golfo Dulce
resultaron positivos.
De 77 tortugas muestreadas en el sitio de forrageo (Golfo Dulce),
un 66% (51) fueron adultos y un 34% (26) juveniles. No se pudo
determinar el sexo de las juveniles, pero todos los adultos
capturados aparentemente fueron hembras, de acuerdo con las
características morfológicas externas.
Analizando los resultados de individuos positivos para CFPHV
determinados para el Golfo Dulce, de los 20 individuos positivos,
13 (26%) positivas de 51 se trataban de tortugas juveniles y 7
(54%) positivas de 26 se trataban de tortugas adultas.
En el caso de la tortuga lora, de un total de 154 muestras
analizados, 14 de RVS Chacocente, 66 de RVS La Flor and 74 de
RVS Ostional. En total 38 (24.7%) de estas muestras resultaron
positivos, seis en RVS Chacocente, 36 (54.5%) en RVS La Flor y 10
(13.5%) en RVS Ostional resultaron positivos.
Todas las tortugas capturadas para este estudio presentaron
buen estado nutricional, es decir sin ojos y plastrón hundidos y sin
presencia de cantidades anormales de percebes. A pesar de la
revisión minuciosa de todas las tortugas analizadas, únicamente
en el RVS Chacocente y en el RVS La Flor se observaron tortugas
con tumoración evidente, todas ellas positivas a CFPHV, no fue
observado para ningún otro sitio tortugas FP.
De estos individuos con FP, las muestras de tumores fueron
positivas en 82% (32 of 39) de los casos y en 34% (14 of 41) de los
casos las muestras de tejido sano de estas mismas tortugas
fueron positivas. Se determinó la presencia de CFPHV DNA en
muestras de tejido sano para estas tortugas con FP, obteniendo
cuatro positivas de ocho para Chacocente RVS y 30% de
positividad de 33 muestras analizadas para La Flor RVS.
Bacterias:
Se obtuvo un total de 175 aislamientos bacterianos aerobios
mesófilos de los cuales 150 pudieron ser identificados con el
sistema Vitek lo que es igual a un 86% de organismos
identificados. De estos el 90,7% corresponde a bacilos gram
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negativos mientras el restante 9,3% representa a cocos gram
positivos.
La mayor cantidad de aislamientos se logró obtener de la
cloaca siendo el 40 % de la totalidad de bacterias identificadas,
seguidas por las aisladas de narinas (35,3%) y por último las de
ojo (24,7%).
El grupo con mayor porcentaje de aislamientos para los tres sitios
anatómicos muestreados fue la familia Vibrionaceae (67,3%),
seguido por los no fermentadores de lactosa (18,8%), cocos
gram positivos (9,3%) y por último las enterobacterias (4,6%).
Para el análisis de la susceptibilidad a los diferentes antibióticos
la interpretación hecha con base en los criterios establecidos por
Vitek fue concordante en la mayoría de los casos con los criterios
que establece el Clinical and Laboratory Standars Institute (CLSI)
2011.
El grupo de antibióticos utilizado para gram positivos y el
porcentaje de organismos con resistencia o sensibilidad a estos.
Todos los aislamientos presentaron resistencia a la penicilina G,
mientras que a otras penicilinas como la amoxicilina con
clavulonato y la ampicilina el 90% fue resistente, la oxacilina que
también es una penicilina pero que presentó una resistencia
mucho menor de un 37% al igual que a cefalosporinas de
primera generación y eritromicina. Un 18% de resistencia se
obtuvo para clindamicina y vancomicina (2/14) y de 10% para
linezolid y tetraciclinas (1/11), por el contrario el 100% resultaron
sensibles a ciprofloxacina, nitrofurantoína y a trimetoprim/sulfa.
Para ningún antibiótico se presentó resistencia intermedia.
Análisis parasitológico:
Se identificó una especie de
ectoparásito y
2 especies
epibiontes en tortugas procedentes de Puerto Jiménez de Costa
Rica. De los ectoparásitos, 3 ejemplares fueron sanguijuelas de la
especie Ozobranchus branchiatus , recolectadas en una tortuga
verde (plastrón), una tortuga negra (plastrón y aletas) y una
tortuga carey (cuello), respectivamente. Los epibiontes fueron
cirripedios de la especie Stephanolepas muricata (2 ejemplares)
en 2 tortugas carey, y de la especie Cheonibia testudinaria (7
ejemplares) en una tortuga verde.
Contaminantes ambientales-plaguicidas:
Sedimento: Ningún plaguicida de los analizados fue encontrado
en el sedimento muestreado.
Pasto marino: De los plaguicidas analizados, se encontró el
herbicida Clomazona en un punto de muestreo de pasto (4.2),
ubicado cerca de la salida del Manglar.
Agua: También se encontró el herbicida Clomazona en dos
muestras de aguas tomadas del Manglar .
Suero sanguíneo: De las diez muestras de suero sanguíneo, de las
tortugas marinas analizadas, no se encontró ningún compuesto
organoclorado.
Composición haplotípica
se identificaron cuatro haplotipos según 11 sitios variables, en la
zona de anidación (CMP4, CMP8, CMP-CR6 y CMP-CR7). Dos
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haplotipos no se lograron emparejar con los de referencia, los
cuales fueron identificados como CMP-CR6 y CMP-CR7 para este
estudio. Estos haplotipos implican nuevos aportes a la diversidad
genética de esta población a nivel regional.
En el Golfo Dulce se encontraron siete haplotipos, basados en 71
sitios polimórficos (Cuadro 1). El más común de la población
muestreada fue el CMP4, con un 65 % (32), seguido por el CMP8
con 14 %.
Diversidad de la estructura genética:
La diversidad haplotípica del sitio de anidación presentó similitud
con otras regiones del Pacífico (h 0.7636 + 0.083) y la
nucleotídica (π 0.01069) fue sustancialmente más alta en Costa
Rica que en los otros sitios de anidación del Pacífico, lo que
refleja el aporte genético a la población de C. mydas. La
variabilidad genética del sitio de forrajeo (h 0.5536 + 0.00602 y π:
0.01034) es baja s para otras poblaciones del Pacífico,
específicamente para Japón (Dethmers et al. 2006). Sin
embargo, fue más alta en comparación con sitios como Hawaii
(Dutton et al. 2008), que se considera un sitio genéticamente
diferenciado del resto del Pacífico. Al comparar la población de
anidación con la de forrajeo, se obtuvo un valor FST =0.0385
(Chi=16.957, p=0.02, df=7), lo que implica que hay flujo génico
entre ambas.
Más Información
(referencias impresas o
digitales)
Participación en eventos



Póster: Análisis descriptivo de las condiciones ambientales y
estado de salud de la tortuga negra (Chelonia mydas
agassizii) que forrajea en el Golfo Dulce de Costa Rica,
presentado en la Reunión Binacional de Medicina de la
Conservación Costa Rica-México, en febrero del 2013.
Ponencia: Evaluación ambiental y genética de sitios con
presencia de la fibropapilomatosis en poblaciones de
Chelonia mydas., presentada en el 2° Congreso Internacional
en Ecología de Enfermedades y Medicina de la Conservación
Kalaan-Kab.
Ponencia: Análisis descriptivo de las condiciones ambientales
y estado de salud de la tortuga negra (Chelonia mydas
agassizii) en un sitio de forrajeo en el Golfo Dulce, Costa Rica,
presentado en el congreso WDA Latin America en setiembre
de 2013.
Referencias de los artículos u otros productos que se proyectan y
revista o medio de publicación:
Presencia de herpes virus en tortuga negra (Chelonia mydas
agassizii) y tortuga lora (Lepidochelys olivacea) del Pacífico de
Costa Rica. En Revision – Journal of Wildlife Diseases
Variabilidad Genética de la tortuga negra (Chelonia mydas
agassizii) del Pacífico de Costa Rica.
Hematología y Química Clínica de la Tortuga negra (Chelonia
mydas agassizii) del Pacífico de Costa Rica.
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Área de Investigación
Valores hormonales de la tortuga negra (Chelonia mydas
agassizii) y tortuga lora (Lepidochelys olivacea) del Pacífico de
Costa Rica.del Pacífico de Costa Rica.
Tesis y proyectos de investigación nuevos:
 Estructura y diversidad genética de la tortuga Chelonia
mydas (FAM: CHELONIIDAE) en el pacífico de Costa Rica,
presentada por Carolina Salas Rojas para obtener su título de
máster en la Escuela de Biología de la UCR.
 Perfiles hematológicos, bioquímicos y hormonales de la
tortuga negra (Chelonia mydas agassizii) en el Golfo Dulce de
Costa Rica. Se halla en proceso de presentación y es una tesis
de pregrado de la Escuela de Medicina Veterinaria de la
UNA.
Contacto
Dr. Gustavo Gutiérrez-Espeleta,
[email protected]