Tema 3A. Aminoácidos Aminoácidos como constituyentes de las proteínas • Estructura estereoquímica • Clasificación y propiedades de sus cadenas laterales • Aminoácidos no estándar • Propiedades físico-químicas Aminoácidos no proteicos Aminoácidos Cadena lateral Grupo amino Grupo carboxilo Aminoácidos L-Alanina Isómero L Isómero D D-Alanina Ionización de aminoácidos Concentración Forma zwitterion Ambos grupos protonados Ambos grupos desprotonados Nomenclatura de aminoácidos Aminoácidos Alifáticos Aromáticos Básicos Polares sin carga Ácidos Aminoácidos apolares Hidrofobicidad Cíclico Dificulta el plegamiento Interior de proteínas Establecen interacciones hidrofóbicas Aminoácidos aromáticos Hidrófobo Ligeramente hidrófobos Interacciones hidrofóbicas Puentes de Hidrógeno Actividad Enzimática Absorben la luz en el UV (280 nm) Aminoácidos polares sin carga Cadenas débilmente polares (algo hidrófilos) Pueden formar puentes de H con el agua Cisteína Cisteína En la superficie de proteínas Dos Cys pueden formar un enlace disulfuro Cistina Aminoácidos básicos Carga + a pH fisiológico Muy polares, en la superficie de proteínas His - El menos básico • pKa próximo a pH neutro • Participa catálisis enzimática (intercambio H+) Aminoácidos ácidos Carga a pH fisiológico Hidrófilos, en la superficie de proteínas Aminoácidos modificados y poco comunes 4-hidroxiprolina Trimetil-lisina Fosfo-serina -carboxiglutámico 3-Metil-histidina N-acetil-lisina 5-hidroxilisina N-metil-arginina Aminoácidos no presentes en proteínas G-ácido aminobutírico (GABA) Histamina Dopamina Tiroxina Homocisteína Citrulina Ornitina Azaserina S-adenosilmetionina Comportamiento ácido-base de los aminoácidos +1 0 -1 Comportamiento ácido-base de los aminoácidos +1 0 -1 pI = pK1 + pK2 2 pH < pI carga + pH = pI sin carga pH > pI carga - [base] pH = pKa + lg [ácido] Comportamiento ácido-base de los aminoácidos Comportamiento ácido-base de los aminoácidos +1 pI = 0 -1 pK1 + pKR 2 -2 = 3,22 +2 +1 pI = 0 pKR + pK2 2 -1 = 7,59 Determinación de aminoácidos