Vectores virales basados en poxvirus Gabriela Calamante Vectores virales • Son virus genéticamente modificados capaces de expresar in vivo o in vitro el/los gen/es de interés • Portan genes foráneos o secuencias integradas en posiciones que no son esenciales para la replicación viral ni para la infectividad (in vitro) . • El virus es el vehículo y el gen foráneo es el gen de interés que codifica para la proteína que se quiere expresar. • Se los clasifica en replicativos o no replicativos (in vivo) • Características más importantes que deben reunir para su uso in vivo: - No replicativos - Inocuos - Estables genéticamente El 1er reporte de un vector viral fue a principios de los ´80 Se demostró que el virus vaccinia (poxvirus) podía ser ingenierizado para portar y expresar genes foráneos Desde entonces la tecnología se aplicó en diferentes familias de virus y para una gran diversidad de genes foráneos (incluyendo los que codifican para antígenos de patógenos) Vectores virales * Potencialmente, todos los virus podrían utilizarse como vectores. * Diferentes virus se pueden utilizar con distintos objetivos. * La integración puede ser importante en algunos casos, como por ej. en terapia génica. * En los virus con genomas de mayor tamaño se puede insertar más cantidad de genes pero… a veces su manipulación es más compleja. Usos * Estudios sobre la biología molecular de los virus. * Estudios de patogenicidad/ virulencia. * Producción y caracterización funcional de proteínas in vitro. * Producción de vacunas. * Terapia génica para reemplazar el gen no funcional. Diseño de un vector viral 1- es necesario estudiar el genoma del vector para identificar al menos una región donde insertar el material genético foráneo 2- los genes de interés deben estar establemente integrados en el genoma del vector 3- la inserción del gen foráneo debe realizarse de tal manera que se garantice su correcta expresión (cantidad, plegamiento, destino final, modificaciones post-traduccionales) Poxvirus Familia Poxviridae Subfamilias - Chordopoxvirinae (vertebrados) 8 géneros Avipoxvirus (FWPV, CNPV), Capripoxvirus, Leporipoxvirus, Molluscipoxvirus, Orthopoxvirus (vaccinia, MVA), Parapoxvirus, Suipoxvirus y Yatapoxvirus. - Entomopoxvirinae (invertebrados) Características • Son virus envueltos complejos que replican en el citoplasma de células de vertebrados e invertebrados. • El ADN viral replica en inclusiones citoplasmáticas electrodensas (cuerpos de inclusión de Guarnieri), denominadas “factories”. • Su genoma está formado por una molécula de ADN de doble cadena lineal de 130-375 kpb, bajo contenido G+C (30-40%). • La partícula viral contiene enzimas que sintetizan los ARNm tempranos. Organización genómica • En los extremos poseen repeticiones terminales invertidas (inverted terminal repeat, ITR) que son idénticas pero orientadas en forma opuesta • Las cadenas están conectadas por regiones en forma de horquilla (contiene cientos de ORFs) cadena polinucleotídica continua •Región central (90-110 genes) genes involucrados en mecanismos básicos de replicación (replicación, transcripción, genes codificantes para proteínas estructurales y de ensamblado, etc) : ALTA HOMOLOGIA ENTRE DISTINTOS POX •Extremos genes considerados no esenciales para la replicación viral, (codificantes para proteínas involucradas en rango de hospedadores o en la virulencia): REGION MAS VARIABLE ENTRE DISTINOS POX Ciclo de replicación Citoplasma Etapa temprana Etapa intermedia Etapa tardía Célula vecina Un poco de historia - Los poxvirus jugaron un rol crucial en el desarrollo de la virología, la inmunología y la vaccinología. - En 1798, Edward Jenner demostró que la inoculación deliberada en humanos del Cowpox virus protegía contra otro poxvirus relacionado que es el agente causal de la viruela (Smallpox virus). - Este hallazgo fundó la ciencia de la inmunología y, eventualmente, condujo a la erradicación de la viruela en 1980 luego de una campaña mundial de vacunación con el virus vaccinia. Esquema de obtención de poxvirus recombinantes El gran tamaño de su genoma impide manipulación directa del ADN recombinación homóloga Vector de transferencia pE- X - t Sitio blanco de inserción poxvirus recombinación homóloga in vivo poxvirus recombinante pE- X - t pE: promotor temprano de poxvirus X: gen de interés. t: terminador de transcripción y traducción La recombinación homóloga ocurre en dos pasos Sustitución alélica por doble recombinación homóloga 5’ Vector de transferencia VV Inserción del plásmido originada por un solo evento de recombinación homóloga en la región 5’ del gen del VV 3’ 5’ Gen no esencial Inserción del plásmido originada por un solo evento de recombinación homóloga en la región 3’ del gen del VV 3’ 5’ Gen no esencial 3’ Gen no esencial salvaje VV recombinante estable VV 5’ 3’ VV recombinante inestable 5´ 5´ 5’ 3’ 5’ VV recombinante inestable 3´ 3´ 5´ 3’ 5’ 3’ 3´ recombinante 2do evento de recombinación intramolecular VV salvaje 2do evento de recombinación intramolecular VV recombinante estable VV salvaje Obtención de poxvirus recombinantes Ingeniería genética 1- Diseñar el vector de transferencia Cultivo 2- Infección de un cultivo celular con el virus salvaje Virología 1’- Subclonar el gen de interés en el vector de transferencia 2´- Transfección del vector de transferencia a las células infectadas recombinación homóloga in vivo (frecuencia 0,4 %) Cultivo Virología Biología molecular Inmunología 3- Seleccionar los poxvirus recombinantes 4- Obtener un stock puro 5- Caracterizar genética y biológicamente los recombinantes seleccionados 6- Evaluar su capacidad de inducir respuestas inmunes específicas en animales (vacunas) Elección del sitio blanco de inserción 1- Genes no esenciales para la replicación en cultivos celulares a) de función conocida Virus vaccinia (2º generación) genes de las enzimas timidina kinasa y hemoaglutinina MVA (3º generación) pueden usarse los mismos genes como blancos de inserción. b) de función desconocida Virus canarypox orf C5 (ALVAC comercializados por Merial) Análisis bioinformático de secuencias disponibles y búsquedas bibliográficas. c) de función conocida evasión de respuesta inmune (4º generación) receptores solubles de citoquinas (IL-1, IFNg, IL-18, etc) Elección del sitio blanco de inserción (cont.) 2- Deleción de genes esenciales para la replicación en cultivos celulares El virus sólo puede crecer si el gen o su producto son provistos en trans. El virus sólo replica in vitro en una línea celular que exprese el producto del gen delecionado. 3- Virus de replicación limitada El virus se puede crecer in vitro en cultivos celulares de una especie. El virus se usa como vector en otra especie en la cual es incapaz de completar el ciclo replicativo pero es capaz de expresar el gen foráneo. Avipoxvirus (CNPV y FWPV) MVA y NYVAC Elección de los promotores La expresión del gen de interés debe estar dirigida por regiones regulatorias de poxvirus a) Promotores b) Terminadores de transcripción y traducción 1) Vector viral replicativo VV en ratones o FWPV en pollos Se pueden usar indistintamente promotores tempranos o tardíos de poxvirus pE/L sintético, p7.5, p11, pATI, pATI-(7.5)3-4 2) Vector viral no replicativo avipox o MVA en mamíferos Sólo se pueden usar promotores tempranos de poxvirus pH6, pE/L sintético, p7.5 pEL t SMC pEL Gen de interés t Selección de los poxvirus recombinantes Teniendo en cuenta que: la eficiencia de transfección es del 0.4% la frecuencia de ocurrencia de doble recombinación no se puede cuantificar el virus salvaje replica normalmente Es fundamental disponer de un sistema que permita seleccionar los virus recombinantes con una alta eficiencia Métodos de selección de los poxvirus recombinantes 1) Selección por resistencia a un compuesto químico a) resistencia a antibiótico no aplicable para el área de vacunas (a menos que se utilice sistema loxP-cre) b) resistencia a ácido micofenólico selección de poxvirus recombinantes que poseen el gen bacteriano gpt (enzima xanthine-guanine phosphoribosyltransferase) MPA bloquea la ruta biosintética de purinas interfiere con la replicación viral Expresión de XGPRT en presencia de MHX sustratos alternativos (X /H) y resistencia a MPA Sólo los virus recombinantes replican y forman placas de lisis Se seleccionan los eventos de simple y doble recombinación c) resistencia a BrdU selección de VV recombinantes TKEn presencia de la enzima TK activa, fosforilación de BrdU e incorporación al DNA viral provoca mutaciones letalidad Posibilidad de mutación espontánea a TK- (10-4) falsos positivos Se combina con un método de screening Se seleccionan los eventos de doble recombinación (reemplazo alélico) 2) Screening por actividad de una enzima marcadora Actividad de las enzimas -galactosidasa o -glucuronidasa codificada por los genes bacterianos lac Z o uid A, respectivamente. Screening por actividad GUS Vector de transferencia pH6- GUS- t pE/L-XX - t Gen no Poxvirus esencial recombinación homóloga in vivo pH6-GUSPoxvirus t recombinante pE/L -XX - t 200X Número de pasaje % placas de lisis azules 1er 0,1% 2do 30-70% 3ro 70-90% 4to 90-100% 5to 100% Caracterización de los poxvirus recombinantes Caracterización molecular de los poxvirus recombinantes Aislamiento en FEP de las placas de lisis azules (stock 100% homogéneo) 1) Análisis mediante PCR sobre ADN total purificado de FEP infectados o no para determinar: A) Presencia del gen de interés B) Pureza del stock recombinante Caracterización de los poxvirus recombinantes (cont.) 2) Evaluación de la expresión del gen de interés en FEP (ARN total o extractos proteicos) A) RT-PCR B) Western blot (anticuerpo específico) C) Inmunofluorescencia (anticuerpo específico) Caracteri- Caracterización biológica: zación de los Cinética de crecimiento inserción no altere capacidad replicativa poxvirus Pasajes ciegos (más de 10) para demostrar estabilidad genética recombi Infecciones de diferentes tipos de cultivos celulares conserva el mismo rango de nantes hospedadores (cont.) Inoculación en animales susceptibles no modificó su virulencia Inoculación en animales no susceptibles no produce lesiones Single - step Replicación de CNPV y CN-X CNPV CN-X Nuestra VIRUS CANARYPOX experiencia… Cepa vacunal (vacuna contra diftero viruela de canario –LaDiPreVet, La Plata) No estaba secuenciado genoma Secuenciación shotgun e identificamos potenciales genes blanco de inserción Utilizamos 2 sitios (CNPV048 y CNPV134) patente nacional para estos vectores Se obtienen y amplifican en FEP Utilizamos como vacunas para: ratones, pollos y bovinos (contra enfermedades virales) Dobles recombinantes (2 antígenos o antígeno + citoquina) MVA Usamos sitios ya descriptos (tk y ha) Se obtienen en FEP y se amplifican en FEP o BHK-21 Utilizamos como vacunas para: ratones, conejos, pollos y bovinos Dobles recombinantes (2 antígenos o antígeno + citoquina) Obtención de MVA con deleción genes involucrados en evasión respuesta inmune VIRUS FOWLPOX Cepa vacunal (Lab. Delamer) Sitios blancos FPV030 (ortólogo a CNPV048) y FPV016 (rIFNg) Se obtienen y amplifican en FEP Utilizamos como vacunas para aves Ventajas del uso de poxvirus recombinantes como vacunas • el virus es extremadamente estable a condiciones ambientales adversas, por lo cual se eliminaría la necesidad de una estricta cadena de frío para su almacenamiento y distribución • la vacuna puede ser administrada por diferentes vías • la capacidad de inducir respuestas tanto humorales como celulares contra el antígeno foráneo, generando inmunidad duradera • la flexibilidad de empaquetamiento del genoma permite delecionar grandes cantidades de genoma viral e insertar al menos 25 kpb de ADN foráneo, permitiendo así crear vacunas multivalentes • los poxvirus recombinantes son genéticamente estables ya que la expresión del gen heterólogo sigue siendo detectada luego de un alto número de pasajes a baja multiplicidad de infección en FEP • la inmunización se consigue en ausencia de replicación viral, se elimina así la posibilidad de una diseminación del vector en los animales vacunados y por consiguiente no es posible la dispersión por contacto hacia animales no vacunados o hacia el ambiente en general. • no se manipula el agente infeccioso en la producción de las vacunas Poxvirus como vacunas La inmunidad pre-existente contra el virus vector interfiere con las dosis refuerzo: MVA: se aplica estrategia prime-boost (combinando DNA/poxvirus) CNPV: no, la inmunidad previa no interfiere (intrínseco del vector) FWPV: en aves puede haber interferencia con anticuerpos maternos anti-viruela Cantidad de dosis y duración de la respuesta: hay muchos y variados ejemplos (depende del antígeno y tipo de respuesta ) diferenciar entre blancos de vacunación (animales de compañía vs de producción) Tipo de respuesta requerida para protección poxvirus inducen principalmente respuestas CD8+ dependiendo de la compartimentalización del antígeno CD4+ y Acs variabilidad cepas patógenas (expresar 1 antígeno o varios?) Mejorar inmunogenicidad co-expresión de citoquinas (GM-CSF, IL-1, IL-18, IL-4) deleción de genes involucrados en evasión de respuesta inmune Poxvirus recombinantes como vacunas Raboral VRG: un ejemplo de vacuna oral contra la rabia en animales silvestres Vacuna: Sobrenadante de cultivo de células BHK infectadas con VVTGgRAB (virus vaccinia recombinante vivo que porta el gen de la glicoproteína G de RV)) Cebo: 50% carne fresca de pescado, 11% de aceite de pescado, 11% de un polímero sintético hidrofóbico (produce el agregado) un sachet de polietileno con 1 dosis de vacuna líquida contiene un biomarcador de la toma del alimento se almacena a 4ºC sin congelar posee resistencia mecánica puede lanzarse desde el aire 1989 1994 1º prueba a campo Conclusiones 1- VVTGgRAB es eficaz, inocuo y estable al calor ofrece una excelente alternativa frente las vacunas a virus rábico atenuadas que se usan en el campo 2- El cebo diseñado es atractivo, eficiente y estable 3- Diseñar estratégicamente la distribución de los cebos (temporal y espacial) Raboral V-RG En EEUU cada año se distribuyen más de 12 millones de dosis de RABORAL V-RG® para prevenir la dispersión de rabia en animales silvestres (principalmente mapaches y coyotes). Existe transmisión pasiva de anticuerpos neutralizantes Las crías pueden ser vacunadas a partir de los 30 días de edad Los anticuerpos maternos no interferían con la inducción de protección Vacunas basadas en poxvirus no replicativos Sólo replican en un número limitado de tipos celulares No producen infección productiva al inyectarlos en aves o mamíferos Existe expresión temprana de genes inducen respuestas inmunes específicas DERIVADOS DE: Virus vaccinia: MVA (virus vaccinia Ankara modificado): atenuado por más de 500 pasajes en FEP NYVAC: atenuado geneticamente por deleción de 18 genes no esenciales (regulación rta inmune y rango hospedadores) Avipoxvirus: CNPV (virus canarypox) FWPV (virus fowlpox) MVA NYVAC Son vectores seguros e inmunogénicos para animales y humanos Utilizando recombinantes que expresan luciferasa se evaluó su biodistribución en ratones A diferencia de WRluc, los recombinantes atenuados expresan el gen reportero transitoriamente (MVA= 24 h, NYVAC= 72 h). Los niveles de luciferasa en los tejidos infectados con MVAluc alcanzan un pico antes que los infectados por NYVACluc. Estos resultados podrian tener relevancia inmunológica cuando se usen como vacunas. MVA CNPV Confirmamos su ausencia de diseminación en pollos SPF MVA-gDs Candidato a vacuna contra BoHV-1 Vía: intraperitoneal En el grupo de animales inmunizados con MVA-gDs se observó: a) Inducción de una respuesta inmune específica b) Menor período de excreción de virus c) Reducción en el número de animales que excretan virus (1 de 4) CNPV-RG Candidato a vacuna antirrábica Evaluación de capacidad protectora en ratones Estabilidad térmica del candidato vacunal CNPV-RG liofilizado Eficacia en modelo de desafío intracerebral en ratón CNPV-RG indujo una respuesta inmune protectora en el modelo ratón Próximos pasos: evaluar su inmunogenicidad en bovinos y/o animales de compañia CNPV-VP2 Candidato a vacuna contra la enfermedad de Gumboro (evaluación en pollos SPF) CVT INTA-Inmuner: evaluar eficacia en aves (desafío con cepa hipervirulenta de IBDV a distintos tiempos postvacunación) Día 1 de edad, vía subcutánea en el cuello 50 días de edad: Infección oral con IBDV (cepa vacunal LZD de virulencia intermedia, dosis: 2,1x103 DICT50/ave) 5 dpi eutanasia y extracción de bolsas de Fabricio: a) c) b) a) Pérdida de la definición corticomedular b) Depleción linfoide c) Infiltrado inflamatorio d) e) d) , e) histología de la bolsa de Fabricio conservada La vacunación al día 1 de edad con CNPV-VP2 indujo una respuesta protectora frente al desafío con una cepa de virulencia intermedia de IBDV. En curso: estudiar protección a diferentes edades (27 y 42 días) en pollos SPF y frente a cepas hipervirulentas de IBDV MVA recombinantes como vacunas (review 2015) Avipoxvirus recombinantes como vacunas (review 2015) No se usan adyuvantes disminuye riesgo reacciones inflamatorias En algunos casos induce protección luego de 1 dosis Sobrepasa los anticuerpos maternos por ej. los antiCDV en cachorros Protección duradera hasta 1 año luego de la vacunación (FeLV, WNV) Puede incorporarse en formulaciones vacunales combinadas Se almacena/transporta a 4ºC Poxvirus recombinantes como vacunas contra HIV 2011 en España finalizó la fase 1 de una vacuna contra HIV • MVA-B que expresa gp120 (monomérica) y poliproteína Gag-Pol-Nef (GPN) • 3 dosis i.m. • 92.3% de respuesta celular T específica (ALTAMENTE INMUNOGENICO) • respuesta amplia: CD4+ contra Env (aumentó luego de 3° dosis) CD8+ similar contra Env, Gag y GPN • Las respuestas se mantuvieron durante 48 semanas (84.6% de los voluntarios) 2003-2009 ensayo de Fase III en Tailandia (RV144) 105 millones U$S >16.000 individuos Régimen prime-boost 1º inoculación: CNPV gag-protease (clado B) y gp120 (clado E) 2º inoculación: vacuna a subunidad gp120 (AIDS/VAX B/E) Virus canarypox no es inhibido por inmunidad pre-existencia contra virus vaccinia (vacuna contra viruela en adultos nacidos antes de 1977) Disminuyó la tasa de infección de HIV alrededor del 31% No tuvo efecto sobre la carga viral en infectados después de vacunación PRIMERA VEZ QUE UN CANDIDATO A VACUNA CONTRA EL SIDA MUESTRA ALGUNA EFICACIA EN PREVENIR LA TRANSMISION DEL VIRUS …eficacia es modesta pero primer resultado alentador en más de 2 décadas MVA VV FWPV Plataformas de la tecnología de: 1) MVA-BN® (Modified Vaccinia Ankara - Bavarian Nordic) 2) Vaccinia/Fowlpox (VF) Desarrollan vacunas contra enfermedades infecciosas e inmunoterapia para cancer MVA-BN se utiliza como vacuna contra viruela Plataforma VF-Tricom 10 VV y 8 FWPV para diversos tipos de cáncer En >100 pacientes (cáncer + metástasis) TAA: Targeted tumor-associated antigens TRICOM (TRIad of COstimulatory Molecules)