FSN_Goutman_abr2016.pdf

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Técnicas de imaging aplicadas a la
neurociencia
Juan D Goutman
18 de abril de 2016
FSN, FCEN, UBA
Célula de Purkinje en el cerebelo
Detección de Ca2+ con Fura-2 en
células de Purkinje
Así se ve
en la realidad!!!!
Tank et al., 1988 Science
Identificación de células específicas en un
tejido
Identificación de interneuronas
GABAérgicas en corteza de ratones
López Bendito et al., 2004; Cerebral Cortex
Usos de moléculas fluorescentes
Identificar estructuras/células
• Moléculas fluorescentes para identificar células: sintéticas
(Alexa, Fluoresceina, Rhodamin)
NF-H
y macromoleculas (GFP, YFP, etc)
(Alexa)
M. Gómez-Casati
Caracterizar procesos
• Para identificar metabolitos: i) Ca2+, Mg2+, pH
ii) sintéticas (fluo, fura, OGB)
y macromoleculas (GCaMP)
• Para medir voltaje (di-8-ANEPPS)
Usos de moléculas fluorescentes
Caracterizar procesos
• Moléculas sensibles a la luz para modificar la actividad neuronal,
concentración de metabolitos, otros: Fotólisis
• Moléculas
sensibles a la luz para modificar excitabilidad/inhibición
En grupos de neuronas: OPTOGENÉTICA
Incluso modular comportamientos animales!!
Plan de la clase:
1. Introducción
2. Indicadores fluorescentes sensibles
a potencial
3. Indicadores fluorescentes sensibles
2+
a Ca
4. Fotólisis
5. Optogenética
6. Resultados del lab
Conceptos básicos de fluorescencia
Diagrama de Jablonski
Conceptos básicos de fluorescencia
Diagrama de Jablonski
- Foto-blanqueo
(reducción en la intensidad
de fluorescencia por
sobre-estimulación)
2do fotón => fotoblanqueo
- Quenching
(reducción en intensidad por
absorción de la energía)
Precursores de la aplicacion de
fluorescencia a la fisiología I
Aequorin
Sensible a Ca2+
Aequora victoria
1962 Osama Shimomura (Marine Biological Laboratory, Woods Hole, MA,
EEUU)
Aequorin
Intensidad de fluorescencia (azul)
de aequorin (sensible a Ca2+)
Aequora victoria expresa dos tipos de
proteínas fluorescentes: Aequorin y GFP!!!
2+
UV
Ca
Aequorin
GFP
Aequorin y GFP: un caso de FRET natural
(Forster Resonance Energy Transfer)
Ca2+
Aequorin
GFP
Roger Tsien: Premio Nobel de Química
2008 (junto a Osama Shimomura y Martin
Chalfie
Cambio de potencial y Ca2+
Baker, Hodgkin & Ridgway 1971
Hodgkin & Horowitz, 1959
1. Indicadores fluorescentes
sensibles a potencial
Indicadores fluorescentes sensible a
potencial
di-8-anepps
10 % de cambio en la señal
cada 100 mV de DV
Indicadores fluorescentes sensible a
potencial
Mutoh et al., 2012
2. Indicadores fluorescentes
2+
de Ca
(Muchas veces como 'sensores' de voltaje)
1. Moléculas sintéticas
2. Moléculas codificadas genéticamente
3. Conceptos básicos y cinéticos
Detección de Ca2+ con Fura-2 en
células de Purkinje
Así se ve
en la realidad!!!!
Tank et al., 1988 Science
Precursores de la aplicacion de
fluorescencia a la fisiología II
BAPTA
Fluoresceina y derivados|
Fluorescein fue sintetizada por
Adolf von Baeyer en 1871
Indicadores fluorescentes de Ca
2+
Fluo-3: BAPTA conjugado a un derivado de fluoresceina
Oregon Green 488 BAPTA-1: BAPTA conjugado a un Oregon Green
Fura2: Indicador 'ratiometrico'
Rhod
Ex 550 nm
Em 580600 nm
Coeficiente
de extincion
Rhod-2
570 nM
82000
Rhod-FF
19 mM
78000
Rhod-5N
320 mM
63000
Fluo
Ex 490-500
Fluo-3
526 nM
Fluo-5F
2.3 mM
Oregon Green BAPTA
Ex 488
Oregon Green BAPTA-1
170 nM
Oregon Green BAPTA-2
580 nM
Oregon Green BAPTA6F
3 mM
Fura
Ex 350 /
380
Fura-2
145 nM
Fura-4F
770 nM
Fura-6F
5.3 mM
Quantum
yield
Em 515520
43000 0.14
Em 520
0.7
Em 420
LifeTechnologies.com
Cómo introducir un indicador dentro de una
célula/s?
• A través de un electrodo de patch-clamp
- Fácilmente controlable su concentración
- Dialisa medio celular
• Uso de moléculas modificadas
con grupos AM (acetometil ester)
- Bulk o local
- No es posible controlar concentración de indicador
- Medio celular parcialmente intacto
2. Indicadores fluorescentes
2+
de Ca
1. Moléculas sintéticas
2. Moléculas codificadas genéticamente
3. Conceptos básicos y cinéticos
Genetically encoded Ca2+ indicators:
GCaMP
GCaMP1
Nakai et al., 2001 Nature Biotech
Genetically encoded Ca2+ indicators:
GCaMP
GCaMP6
Reporteros leeeeentooooooos
Chen et al., 2013 Nature
Uso de GCaMP
Silbering & Galizia, 2007
Alternativa!!!
Laboratorio de Henry Markram, EPFL, Suiza.
Ventajas y desventajas de indicadores sintéticos y
geneticos
Genéticos:
11-Expresión
Expresióndireccionable.
direccionable.
Transgénicos
Transgénicos(ojo
(ojonivel
nivelde
deexpresión)
expresión)
In
utero
electroporation
In utero electroporation
Infeccion
Infeccionviral
viral
2Se
mantiene
2- Se mantieneelelmedio
mediointracelular
intracelularintacto.
intacto.
OJO
OJO
1-1-Difícil
Difícildeterminar
determinarconcentración
concentraciónintracelular.
intracelular.
2-2-Poca
Pocavariedad
variedadde
deafinidades
afinidadespor
porCa
Ca2+.2+.
3-3-Interfiere
Interfiereen
enlalacinética
cinéticaintrínseca
intrínsecade
delalaseñal.
señal.
33-Alta
Altaestabilidad
estabilidadpara
paramediciones
medicionesde
delargo
largo
plazo.
plazo.
Sintéticos:
11-Gran
Granabanico
abanicode
delongitudes
longitudesde
deonda
onda
11-Mediciones
Medicionescortas
cortas(bleaching
(bleachingyyotras)
otras)
22-Gran
Granvariedad
variedadde
deafinidades
afinidades
22-Interfiere
Interfiereen
enlalacinética
cinéticaintrínseca
intrínsecade
delala
señal.
señal.
3-”Baratos”
3-”Baratos”
2. Indicadores fluorescentes
2+
de Ca
1. Moléculas sintéticas
2. Moléculas codificadas genéticamente
3. Conceptos básicos y cinéticos
Transientes de Ca2+ producidos por un PA o un
tren resueltos con indicador de baja afinidad
Oregon Green
BAPTA 5N
Nakamura et al., 2015 Neuron
2+
Dinámica del Ca intracelular
Ca2+-OGB5
Ca2+-Buffer1
+ OGB5
+ Buffer1
Ca2+
“LIBRE”
+ Buffer2
Ca2+-Buffer2
Intracelular
Extracelular
Ca
2+
Ca2+
Ca2+
Ca2+
2+
Dinámica del Ca intracelular
Ca2+-OGB5
Ca2+-Buffer1
+ OGB5
+ Buffer1
2+
2+
Los indicadores de
Ca Ca son bufferes de Ca !!!!
2+
“LIBRE”
+ Buffer2
Ca2+-Buffer2
Ca2+ Ca2+
Ca2+
Ca2+
2+
Relación entre [Ca ] y fluorescencia
En equilibrio:
Kd
2+
Ca + F
k+
Ca-F
kEn equilibrio:
kKdCa =
k+
k- KdCa
Afinidad
k- KdCa
Afinidad
Ca2+ + F
k+
k-
Ca-F
En el equilibrio:
kKdCa =
k+
[Ca][F ]
KdCa =
[CaF ]
Importante!!:
i) Medir DF fuera de la saturación
del indicador
ii) La relación entre la F y [Ca2+] es
lineal SÓLO cuando [Ca2+] << Kd
[Ca2+] = F-Fmin
Fmax - F
Valores de k+ y k- para algunos
indicadores de Ca2+
Importante!!:
i) Medir DF fuera de la saturación del
indicador
ii) La relación entre la F y [Ca2+] es
lineal SÓLO cuando [Ca2+] << Kd
[Ca2+] = F-Fmin
Fmax - F
Valores de k+ y k- para algunos indicadores
2+
de Ca
Relativamente
constante
Dinámica intrínseca de indicadores de Ca
Fluo-3 (>afinidad)
2+
Ca2+ uncaging:
Genera una 'espiga' de Ca2+
[Ca2+] basal = 100 nM
[indicador] = 100 mM
CaOrange-5N (< afinidad)
2+
Ca + F
k+
k-
Ca-F
Escobar et al., 1994
Transientes de Ca2+ producidos por un PA o un
tren resueltos con indicador de baja afinidad
Oregon Green
BAPTA 5N
Nakamura et al., 2015 Neuron
Límite de difracción de un microscopio óptico
Nakamura et al., 2015 Neuron
Simon & Llinas, 1985
Resolution limit due to diffraction of Light
Calibración de Fura-4F en set-up
10 mM EGTA
Rmin ~ 0.5
10 mM HEDTA+1.8 mM Ca2+ R1mM ~ 1
10 mM Ca2+
Rmax ~ 10
[Ca]=Keff ∗(
Grynkiewicz et al., 1985
R−Rmin
)
Rmax−R
Calibracion de fura4F en lab
3. Fotólisis
Precursor
fotolábil
hn
Ligando activo
Fotólisis
1. Intracelular o Extracelular
2. Permite producir cambios muy rápidos de
concentración de distintas especies
3. Inactivación de proteínas
Fotólisis
Fotólisis
Compuestos comerciales para desenjaular:
ATP
IP3
Ca2+
GABA
Glutamato
Fotólisis de Ca
2+
DM-nitrophen (o Caged-Ca2+)
Afinidad por Ca2+ cambia de 7 nM a 3 mM. Una difrencia de 105
Sensible a luz UV
Fotólisis de Ca
Heidelberger & von Gersdorff, 2005
2+
Fotólisis de Ca
Schneggenburger & Neher, 2000
2+
Libros:
Fundamentals of Light Microscopy and electronic imaging. Douglas Murphy.
Willey-Liss inc.
Imaging in Neuroscience and Development. A Laboratory Manual. Edited by
R. Yuste & A. Konnerth
Páginas web:
Olympusmicro.com
LifeTecnologies.com
Papers:
Neher, E. Cell Calcium (1998) 24, 345-357.
Sala & Hernandez-Cruz (1990) Biophys J 57, 313-324
Escobar et al., (1997) Eur J Physiol. 434, 615-631
4. Optogenética
Las estrellas de la optogenética
Channelrhodopsin
Halorhodopsin
Alga Chlamydomonas reinardtii
Retinal:
Una “antena” para la luz
hn
Channelrhodopsin expresada en neuronas
hipocampales
Boyden et al., 2005 Nat Neurosci
Métodos de estimulación neuronal
antes (y después) de la optogenética
- Fotólisis
- aplicación de drogas
Espectro y cinéticas de opsinas
La optogenética consiste de:
• Tecnología central para controlar excitabilidad neuronal con luz
• Tecnología para dirigir luz de determinada longitud de onda
en tejidos
• Tecnología para dirigir la expresión de las proteínas de interés
en las células de interés
• Tecnología para obtener mediciones, realizar análisis, como
imaging y electrofisiología
Métodos de expresión de opsinas:
I. Transgénicos
Métodos de expresión de opsinas:
I. Virus
Fenno et al., 2011
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